Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Krcc1Q99JT5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Krcc1Q99JT5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Krcc1Q99JT5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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