Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bgrl3Q91VW3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms