Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdk8Q8R3L8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk8Q8R3L8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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