Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgbQ8K0E8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FgbQ8K0E8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms