Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Als2cr12Q8BVM7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Als2cr12Q8BVM7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms