Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms