Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms