Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4bQ8BGE6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Atg4bQ8BGE6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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