Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmed3Q78IS1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms