Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9c1Q6UJY2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9c1Q6UJY2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms