Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pik3c3Q6PF93 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pik3c3Q6PF93 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms