Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms