Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna1eQ61290 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cacna1eQ61290 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms