Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cdh12Q5RJH3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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