Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc8bQ5DU41 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms