Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chsy3Q5DTK1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chsy3Q5DTK1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms