Protein–RNA interactions for Protein: Q505D9

Trim67, Tripartite motif-containing protein 67, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim67Q505D9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim67Q505D9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim67Q505D9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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