Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc160Q3UYG1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc160Q3UYG1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc160Q3UYG1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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