Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zyg11bQ3UFS0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms