Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q3U595 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q3U595 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q3U595 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q3U595 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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