Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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