Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3TTJ4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3TTJ4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms