Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2bQ3TD49 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2bQ3TD49 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms