Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC15Q0P6D6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms