Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Neurl1bQ0MW30 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms