Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms