Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms