Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RargP18911 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RargP18911 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RargP18911 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms