Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rps6ka1P18653 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms