Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXB9P17482 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms