Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms