Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Becn2P0DM65 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms