Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syngr2O55101 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syngr2O55101 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms