Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2f6O54917 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms