Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NumblO08919 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NumblO08919 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms