Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTL1A6NKG5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL1A6NKG5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms