Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CtcflA2APF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms