Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cldn6Q9Z262 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms