Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx1Q9WV80 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms