Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms