Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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