Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sar1bQ9CQC9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms