Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chmp3Q9CQ10 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chmp3Q9CQ10 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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