Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms