Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc115Q8VE99 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc115Q8VE99 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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