Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Stx18Q8VDS8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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