Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpusd1Q8VCZ8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpusd1Q8VCZ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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