Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpm8Q8R4D5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpm8Q8R4D5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms