Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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