Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cep55Q8BT07 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cep55Q8BT07 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms